Mario Mimeault a reçu en 2000 le Prix du Gouverneur général du Canada pour l'excellence de son enseignement de l'histoire canadienne. Il a publié au Septentrion Destins de pêcheurs en 2011 et L'Exode québécois en 2013, qui lui a valu le Prix Clio-Québec. Le prix Guy-et-Lilianne-Frégault lui été attribué pour son article publié dans la Revue d'histoire de l'Amérique française.